El Organismo ha participado en la ejecución de grandes obras hidráulicas que han recibido financiación de la Comisión Europea a través de los Fondos Estructurales FEDER y Fondo de Cohesión.
En el último período de ayudas en el que ha participado el Organismo, Fondos 2007/2013, el resumen de las actuaciones es el siguiente: